Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD50Q92878 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD50Q92878 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms