Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CSRNP3Q8WYN3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CSRNP3Q8WYN3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
CSRNP3Q8WYN3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms