Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4AQ8WYN0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms