Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIRE2Q8WWL2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms