Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HAVCR2Q8TDQ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HAVCR2Q8TDQ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HAVCR2Q8TDQ0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HAVCR2Q8TDQ0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HAVCR2Q8TDQ0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HAVCR2Q8TDQ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HAVCR2Q8TDQ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HAVCR2Q8TDQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms