Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX54Q8TDD1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX54Q8TDD1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms