Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00518Q8N0U6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms