Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXP4Q8IVH2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP4Q8IVH2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms