Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALYREFQ86V81 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALYREFQ86V81 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms