Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC11Q7Z392 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms