Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTOP3Q7RTS5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms