Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTF1AQ7RTS3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTF1AQ7RTS3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms