Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED13LQ71F56 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13LQ71F56 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13LQ71F56 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13LQ71F56 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13LQ71F56 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13LQ71F56 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13LQ71F56 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13LQ71F56 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13LQ71F56 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13LQ71F56 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED13LQ71F56 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms