Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPGS1Q6ZTW0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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