Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VITQ6UXI7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms