Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms