Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf54Q6UWD8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms