Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRAIDQ6UW56 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms