Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD1Q6SPF0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD1Q6SPF0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms