Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms