Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC174Q6PII3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms