Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR4

TTI2, TELO2-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTI2Q6NXR4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTI2Q6NXR4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTI2Q6NXR4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms