Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCTP1Q6DN14 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCTP1Q6DN14 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms