Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG16L1Q676U5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms