Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRAGBQ5VZM2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRAGBQ5VZM2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms