Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH2Q5VUJ6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH2Q5VUJ6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms