Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms