Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q5VSD8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q5VSD8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q5VSD8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q5VSD8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q5VSD8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q5VSD8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q5VSD8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q5VSD8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q5VSD8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q5VSD8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q5VSD8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q5VSD8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q5VSD8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q5VSD8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q5VSD8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q5VSD8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms