Protein–RNA interactions for Protein: Q5U623

ATF7IP2, Activating transcription factor 7-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IP2Q5U623 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF7IP2Q5U623 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms