Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC18Q5T9S5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CCDC18Q5T9S5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC18Q5T9S5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC18Q5T9S5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC18Q5T9S5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC18Q5T9S5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC18Q5T9S5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms