Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD3Q5JV73 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD3Q5JV73 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD3Q5JV73 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD3Q5JV73 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD3Q5JV73 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD3Q5JV73 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms