Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFHC2Q5JST6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC2Q5JST6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms