Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF6Q58WW2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms