Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AA4PQ58FG1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AA4PQ58FG1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms