Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms