Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LACTB2Q53H82 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LACTB2Q53H82 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms