Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUSP28Q4G0W2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP28Q4G0W2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms