Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms