Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL38Q2WGJ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms