Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIDA1Q1XH10 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIDA1Q1XH10 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms