Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LONRF1Q17RB8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LONRF1Q17RB8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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