Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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