Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FXNQ16595 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
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FXNQ16595 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FXNQ16595 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FXNQ16595 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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FXNQ16595 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FXNQ16595 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FXNQ16595 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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FXNQ16595 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FXNQ16595 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FXNQ16595 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FXNQ16595 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FXNQ16595 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FXNQ16595 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FXNQ16595 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FXNQ16595 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FXNQ16595 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FXNQ16595 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FXNQ16595 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FXNQ16595 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FXNQ16595 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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FXNQ16595 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FXNQ16595 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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FXNQ16595 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FXNQ16595 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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FXNQ16595 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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FXNQ16595 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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FXNQ16595 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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FXNQ16595 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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FXNQ16595 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FXNQ16595 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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