Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNXAQ16473 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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