Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SSX1Q16384 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SSX1Q16384 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SSX1Q16384 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SSX1Q16384 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SSX1Q16384 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SSX1Q16384 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SSX1Q16384 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SSX1Q16384 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX1Q16384 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX1Q16384 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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