Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIBQ15653 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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