Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDK1Q15118 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms