Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.311e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 FAM192A-220ENST00000569266 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.581e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.821e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 FAM192A-202ENST00000389447 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 FAM192A-211ENST00000565956 618 ntTSL 36.98□□□□□ -1.291e-10■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 FAM192A-213ENST00000566403 1396 ntTSL 56.81□□□□□ -1.321e-10■■□□□ 13.3
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PUM1Q14671 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-6■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 METAP2-211ENST00000553151 564 ntTSL 516.45■□□□□ 0.221e-12■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 STRN4-211ENST00000595357 1602 ntTSL 215.44■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.278e-8■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.182e-11■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.532e-11■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.941e-7■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.351e-7■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.531e-7■■□□□ 13.3
PUM1Q14671 GTF2I-213ENST00000613513 538 ntTSL 420.74■□□□□ 0.913e-14■■□□□ 13.2
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PUM1Q14671 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -03e-14■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.043e-14■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.063e-14■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.123e-14■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.173e-14■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.173e-14■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 GTF2I-201ENST00000432143 572 ntTSL 48.88□□□□□ -0.993e-14■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 OPA1-212ENST00000445863 1096 ntTSL 36.72□□□□□ -1.333e-14■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 SNRPB-203ENST00000474384 985 ntTSL 517.78■□□□□ 0.444e-12■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.244e-12■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.144e-12■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 MAP7D1-209ENST00000487131 733 ntTSL 518.77■□□□□ 0.62e-6■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 RPL19-203ENST00000577759 564 nt10.71□□□□□ -0.692e-51■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.471e-6■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 SLTM-220ENST00000559880 717 ntTSL 310.63□□□□□ -0.712e-7■■□□□ 13.2
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PUM1Q14671 BCCIP-204ENST00000463330 500 ntTSL 34.59□□□□□ -1.673e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 PLEC-211ENST00000527303 598 ntTSL 323.53■■□□□ 1.366e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 MRPS5-206ENST00000475895 1672 ntTSL 215.94■□□□□ 0.141e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 EIF4G1-229ENST00000457456 983 ntTSL 28.77□□□□□ -1.011e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.598e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 NRDC-205ENST00000468722 754 ntTSL 317.59■□□□□ 0.415e-12■■□□□ 13.2
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PUM1Q14671 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.141e-323■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 YWHAZ-221ENST00000523131 567 ntTSL 523.19■■□□□ 1.37e-7■■□□□ 13.2
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PUM1Q14671 YWHAZ-223ENST00000523938 626 ntTSL 520.44■□□□□ 0.867e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 YWHAZ-210ENST00000437293 701 ntTSL 319.82■□□□□ 0.767e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.367e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 YWHAZ-216ENST00000521309 1399 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.527e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.727e-7■■□□□ 13.2
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PUM1Q14671 YWHAZ-202ENST00000395948 812 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -17e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.737e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.787e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 DIAPH1-213ENST00000523100 1180 ntTSL 524.66■■□□□ 1.546e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 PSMA7-205ENST00000484488 1023 ntTSL 324.72■■□□□ 1.553e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.733e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 PSMA7-204ENST00000442551 685 ntTSL 314.41□□□□□ -0.13e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.421e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.251e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.521e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.481e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 MORF4L1-208ENST00000558746 874 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 MORF4L1-222ENST00000560710 908 ntTSL 29.06□□□□□ -0.961e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 MORF4L1-212ENST00000559158 793 ntTSL 37.92□□□□□ -1.141e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 MORF4L1-223ENST00000561171 933 ntTSL 26.81□□□□□ -1.321e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 MORF4L1-221ENST00000560422 761 ntTSL 56.33□□□□□ -1.41e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.461e-7■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 PTBP1-206ENST00000585856 1217 ntTSL 228.88■■■□□ 2.218e-13■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 KMT2B-205ENST00000606995 195 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.822e-16■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.914e-6■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-6■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 SF3B2-208ENST00000529994 1004 ntTSL 212.7□□□□□ -0.382e-18■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 PRPF4B-205ENST00000480058 6775 ntTSL 1 (best)5.89□□□□□ -1.476e-6■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.66e-6■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.212e-11■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.452e-11■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.522e-11■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CCAR1-212ENST00000540210 3415 ntTSL 1 (best)4.05□□□□□ -1.762e-11■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.615e-8■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.499e-7■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.16e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.376e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 217.87■□□□□ 0.454e-15■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 315.86■□□□□ 0.134e-15■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.584e-15■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 511.24□□□□□ -0.614e-15■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.734e-15■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.84e-15■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.824e-15■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 SNAP29-203ENST00000490458 972 ntTSL 218.15■□□□□ 0.57e-8■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 MORC3-207ENST00000546482 1028 ntTSL 27.27□□□□□ -1.251e-6■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 MORC3-209ENST00000549948 934 ntTSL 26.58□□□□□ -1.361e-6■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 MORC3-211ENST00000551788 867 ntTSL 25.7□□□□□ -1.51e-6■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 MORC3-212ENST00000552581 875 ntTSL 35.7□□□□□ -1.51e-6■■□□□ 13.1
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