Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUL1Q13616 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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