Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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