Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFFO1Q0D2I5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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